Клиника была основана 25 января 1993 года профессором А.И. Никитиным. Именно под его руководством в 80-х годах впервые в России был разработан метод оплодотворения ооцитов человека in vitro, который лег в основу развития современных вспомогательных репродуктивных технологий. А в 1986 году был рождён первый младенец, зачатый в пробирке.
Уже 30 лет БИРЧ помогает женщинам и мужчинам даже в сложных случаях бесплодия.
На 2023 год Балтийский институт репродуктологии человека – одна из самых результативных клиник планирования семьи в Санкт-Петербурге. Ежегодно процент успешных протоколов ЭКО в медицинском институте БИРЧ составляет больше 53,5%.